Iodobacter
Pour cultiver des micro-organismes tels que les bactéries, les levures ou les champignons, plusieurs paramètres doivent être optimisés, surveillés et contrôlés. C'est pourquoi il est nécessaire de disposer d'un bioréacteur équipé de plusieurs capteurs, de pompes et d'un système de gestion de l'aération. Les micro-organismes sont cultivés dans des conditions axéniques (présence d'un seul organisme) afin d'obtenir une reproductibilité élevée. Ils se développent dans l'obscurité, en utilisant une source de carbone telle que le glucose, en fonction de leurs besoins.
En collaboration avec des spécialistes de l’université de Santiago, au Chili, nous avons isolé plusieurs micro-organismes. L’expédition s’est déroulée sur un glacier situé près de Zermatt, en Suisse, et l’objectif de l’étude était de découvrir des micro-organismes capables de se développer dans un tel environnement malgré des conditions extrêmes. En raison du recul constant des glaciers au cours des dernières décennies, des microbes qui étaient auparavant cachés sous une couche de glace permanente sont désormais accessibles. Des chercheurs de Mibelle Biochemistry ont prélevé des échantillons de bactéries extrêmophiles sous le glacier, qui étaient restés enfouis sous la glace pendant des centaines d’années. Les échantillons ont ensuite été analysés pour déterminer leur composition microbienne, et plus de 80 souches microbiennes ont été isolées. Le séquençage du génome complet d’une souche isolée a permis d’identifier Iodobacter ssp., une bactérie Gram-négative en forme de bâtonnet, psychrotolérante. Cette bactérie produit des pigments violets et des exo polysaccharides. Le terme grec « ioeides » fait référence à la couleur violette. Iodobacter est psychrotolérante, ce qui signifie qu’elle peut tolérer et se développer à des températures proches du point de congélation. Nous la cultivons sous une forme non violette. Pour la production de biomasse dans un bioréacteur, un travail approfondi de mise au point des conditions de croissance et de la composition des milieux de culture a été nécessaire.